Contrairement aux fibres, les protéines dans le côlon font du tort
S’il est tout à fait normal que les fibres alimentaires atteignent en masse le côlon – puisque par définition elles ne sont pas digérées dans le tractus digestif supérieur – les protéines, elles, sont normalement absorbées au niveau du grêle. Les bactéries du côlon utilisent de préférence les glucides issus de la dégradation des fibres, et moins les protéines, qui ne sont pas leur substrat de prédilection.